马耳他公司每年必须提交的文件
拥有一家马耳他公司意味着一份日历般的申报安排。漏掉一项，退税就会中断。以下是完整清单及各项的到期时间。
在马耳他维持一家公司合规的成本很低，但一旦疏忽，代价却很高。以下每项义务都附带罚则，而其中最重要的后果并非罚款：一家账目和申报未妥善处理的公司无法支付支持退税的股息，因此5%的实际税率取决于这份日历是否被严格遵守。
向马耳他商业registry（Malta Business Registry）申报
年度申报表（Annual return）。 于注册周年日到期，费用视法定股本而定。该申报确认注册办事处、董事、公司秘书及股东信息。
年度财务报表。 每家公司都必须编制财务报表，除极少数最小型公司可获豁免外，均须由马耳他注册核数师审计。私人公司须在财政年度结束后十个月内将账目提交股东大会审议，并在其后42天内向Registry备案。默认的财政年度结束日为12月31日。
实益拥有人登记册（register of beneficial owners）。 每家公司须保存记录最终拥有或控制该公司的自然人的登记册，向Registry备案，并随年度申报表每年确认一次。变更须在十四天内通知。
发生变更时的申报。 董事、公司秘书、注册办事处或股东的变更须以规定表格在法定期限内（通常为十四天）通知Registry。
向马耳他税务及海关管理局（Malta Tax and Customs Administration）申报
公司所得税申报表。 于财政年度结束后九个月内到期，因此12月年结的公司须于9月30日前申报，另需参考该机构每年公布的电子申报延期安排。税款通过年内的临时税款支付结算，并在申报时结清余额。申请退税制度的公司须提交股息凭单（dividend warrant），股东则在分配后提出退税申请。
增值税申报表。 根据Article 10注册的公司须按季度申报，一般于期末后六周内到期。根据Article 11注册的公司则须提交年度申报。欧盟内部贸易适用汇总申报表（recapitulative statements）及Intrastat申报。
薪资事宜。 雇有员工的公司须依据最终结算制度（Final Settlement System）扣除税款及社会保障金，按月缴纳，并提交年度FS7及FS3表格。
关于注册办事处
马耳他法律要求公司在马耳他设有注册办事处，并设有公司秘书（company secretary），该秘书无须为马耳他居民，但必须是自然人。董事会及股东会议记录、法定登记册及会计记录须存放于注册办事处，并须可供Registry及税务机关查阅。
全年成本几何
政府收费金额不大。真正的专业成本在于会计、审计及税务申报，其费用随公司业务活动规模而变化。一家休眠控股公司与一家每月开出五十张发票的贸易公司所需的服务完全不同，报价单应明确说明所报价的对象是哪一种情况。
常见问题
- 每家马耳他公司都需要审计吗？
- 几乎都需要。马耳他法律要求提交经审计的财务报表，仅对极少数最小型公司有豁免。审计同时也是账目能被接受用于退税申请的前提。
- 马耳他公司税申报表的截止日期是什么时候？
- 财政年度结束后九个月内，因此12月31日年结的公司须于9月30日前申报，具体须参考每年公布的电子申报延期安排。
- 如果年度申报表逾期提交会怎样？
- Registry会按延误时间收取递增罚款，若公司持续违约，可能会被除名（struck off）。被除名公司的资产将转归政府所有，直至公司恢复登记为止。